近日，首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院張艷團(tuán)隊(duì)在感染領(lǐng)域知名學(xué)術(shù)期刊《Journal of Infection》（《感染雜志》）上發(fā)表題為“Evaluation of metagenomic and pathogen-targeted next-generation sequencing for diagnosis of meningitis and encephalitis in adults: A multicenter prospective observational cohort study in China”的研究論文。該多中心、前瞻性觀察性隊(duì)列研究結(jié)果提示，對(duì)于感染性M/E，腦脊液（CSF）的二代測(cè)序（NGS）檢測(cè)可以在傳統(tǒng)微生物檢測(cè)范圍之外提供更多的病原體信息，而且對(duì)于常見病原體，病原體靶向NGS（ptNGS）似乎比宏基因組NGS（mNGS）具有更好的檢測(cè)性能。首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院陳衛(wèi)碧為本文第一作者，張艷和吳英鋒主任醫(yī)師為共同通訊作者。

中樞神經(jīng)系統(tǒng)（CNS）感染是一種高發(fā)病率和高病死率的復(fù)雜疾病，早期診治是決定患者預(yù)后的關(guān)鍵，然而顱內(nèi)病變的病因診斷極具挑戰(zhàn)。在臨床上，即使病因不同（感染性或非感染性），顱內(nèi)病變的臨床表現(xiàn)可以相似，而傳統(tǒng)的診斷技術(shù)（包括病原體培養(yǎng)、抗原/抗體測(cè)定和PCR測(cè)定）雖長期以來一直用于病原體檢測(cè)，但其檢測(cè)性能有限，超50%以上的腦炎通常不能檢測(cè)到病原體。因此，顱內(nèi)感染的抗感染治療大多是經(jīng)驗(yàn)性的，臨床上迫切需要一種對(duì)致病微生物能夠進(jìn)行早期并高效診斷的檢測(cè)方法。

二代測(cè)序（NGS）進(jìn)行病原體鑒定是一個(gè)新興技術(shù)，但在顱內(nèi)感染的病原體診斷中，不同類型NGS的應(yīng)用研究有限。為明確腦脊液（CSF）病原體檢測(cè)的最佳方法，研究者依托于中國科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目發(fā)起了一項(xiàng)多中心、前瞻性觀察性隊(duì)列研究，對(duì)比分析了病原體靶向NGS（ptNGS）、宏基因組NGS（mNGS）和綜合的傳統(tǒng)微生物學(xué)分析方法對(duì)感染性腦膜炎/腦炎（M/E）的診斷效果。研究結(jié)果顯示，多中心入組的152例臨床診斷為疑似M/E患者，CSF標(biāo)本在傳統(tǒng)微生物學(xué)分析基礎(chǔ)上，同步行ptNGS和mNGS病原體分析。89例確診感染性M/E患者，分別有57例和39例患者通過ptNGS和mNGS明確了致病微生物檢測(cè)。經(jīng)差異分析，ptNGS的總體準(zhǔn)確率為65.1%，陽性符合率（PPA）為64%，陰性符合率（NPA）為66.7%；而mNGS總體準(zhǔn)確度為47.4%， PPA為43.8%，NPA為52.4%。

在這項(xiàng)研究中，證實(shí)了使用CSF的NGS對(duì)感染性M/E的診斷效率：（1）CSF的NGS檢測(cè)能在傳統(tǒng)的微生物檢測(cè)范圍之外額外提供病原體信息；（2） 在兩種不同的病原體檢測(cè)技術(shù)之間，ptNGS在常見病原體檢測(cè)方面似乎優(yōu)于mNGS（總體準(zhǔn)確率：65.1%對(duì)47.4%）。該研究結(jié)果為顱內(nèi)感染的檢測(cè)方法的選擇提供了依據(jù)。

該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃（2020YFC2005403）項(xiàng)目的支持。